| Šifra: |
253570 |
| ECTS: | 4.0 |
| Nositelji: |
prof. dr. sc.
Dunja Leljak-Levanić
izv. prof. dr. sc. Rosa Karlić |
| Izvođači: |
dr. sc.
Mateja Jagić
- Vježbe u praktikumu prof. dr. sc. Dunja Leljak-Levanić - Vježbe u praktikumu |
| Prijava ispita: | Studomat |
| Opterećenje: | |||||||
|
|||||||
| Opis predmeta: | |||||||
Svrha predmeta je jducirati studente o znanstveno-istraživačkoj metodologiji u biologiji i srodnim znanostima. Postići razinu razumijevanja povezanosti pravilne primjene znanstvene metode s ishodima istraživanja. Na primjerima jednostavnih istraživanja upoznati studente sa ulogom hipoteze, predviđanja, osmišljavanja eksperimenta, uzorkovanja i veličine uzorka. Nadalje, cilj je upoznati studente s osnovama analize bioloških podataka uz praktične zadatke u statističkom okruženju R, interpretaciju i prezentaciju rezultata. |
|||||||
| Literatura: | |||||||
|
|
|||||||
| 1. semestar |
Obavezni predmet - Redovni Studij - Molekularna biologija |
Drage studentice i studenti,
ova obavijest nema veze s kolegijem, a tema obavijesti dana je dodanim dokumentima, na zamolbu prof. dr. rer. nat. Tomislav Domazet-Lošo. Mislim da ste vi interesna skupina pa koristim ovaj kolegij za širenje informacije.
D Leljak Levanić
DIPLOMSKI RAD ILI STUDENTSKA PRAKSA
Filostratigrafska analiza ekologije riba
Parafiletska skupina poznata kao ribe postoji još od kambrijske eksplozije i danas je
najraznolikija grupa kralježnjaka. Njihova zapanjujuća filogenetska, morfološka i ekološka
raznolikost čini ih nepresušnim izvorom evolucijskih priča poput nastanka špiljskih oblika ili
specijacije afričkih ciklida, ali nedostaje makroevolucijska sinteza.
Širi pogled na evoluciju omogućuje nam bioinformaBčka metoda genomske filostraBgrafije
koja je korištena u mnogim fundamentalnim istraživanjima, a razvijena je u našem
laboratoriju. Genom svake vrste sadrži oBsak njene cjelokupne evolucijske povijesB—geni i
genske obitelji nastajali su postupno Bjekom vremena pod utjecajem različiBh evolucijskih
procesa. Budući da su sve živuće vrste međusobno srodne, svakom čvoru (filostratumu) na
filogenetskom stablu možemo pridružiB genske obitelji koje su nastale u tom razdoblju te tu
informaciju iskorisBB za promatranje evolucije svojstava u različiBm linijama. U biološkim
bazama podataka dostupno je gotovo 400 anoBranih genoma riba, što omogućava sastavljanje
detaljno razlučene filogenije za filostraBgrafsku analizu.
Temeljna ideja ovog istraživanja je promotriB evoluciju osnovnih značajki ekologije riba kroz
stoBne milijuna godina njihovog postojanja.
Ključni koraci u provedbi ovog projekta su:
1. pripremiB kvalitetnu bazu za filostraBgrafsku analizu
2. anoBraB značajke ekologije vrsta u pripremljenoj bazi
3. filostraBgrafski mapiraB gene riba u bazi
4. koreliraB evoluciju gena s odabranim ekološkim značajkama
Tijekom provedbe ovog istraživanja upoznat ćete se s:
1. korištenjem bioinformaBčkih alata
2. osnovama programiranja
3. upotrebom bioloških baza podataka
4. teorijom i praksom filostraBgrafije
5. međuinsBtucionalnom suradnjom i pisanjem znanstvenog rada
Prethodno iskustvo nije potrebno, ali samostalnost i snalažljivost jesu.
Laboratorij za evolucijsku geneBku, InsBtut Ruđer Bošković, Zagreb
U suradnji s InsBtutom za oceanografiju i ribarstvo, Split
Pod vodstvom:
Prof. dr. rer. nat. Tomislav Domazet-Lošo
Niko Kasalo, mag. biol. exp.
Za više informacija javite se na mail: nkasalo@irb.hr
Horvatovac 102a
10 000 Zagreb
Tel:+385(0)1 4606 000
dekanat@dekanat.pmf.hr
Za medije: prpmf@dekanat.pmf.hr
Naslovnica
O fakultetu
Opći podaci
Ustrojstvo fakulteta
Knjižnice fakulteta
Ravnice 48
10 000 Zagreb
: +385 (91) 4605 991
: +385(0)1 4826 260
: uredbo@biol.pmf.hr
OIB:
28163265527
IBAN:
HR5823600001101522208
© 2025. Prirodoslovno - matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu
Powered by Ekorre Academic
Pristupačnost
